中國科學院大學數(shù)學科學學院前身為1978年成立的中國科技大學研究生院（北京）數(shù)學教學部，2002年9月更名為中國科學院研究生院數(shù)學系，2006年6月與中國科學院數(shù)學與系統(tǒng)科學研究院聯(lián)合組建成立中國科學院研究生院數(shù)學科學學院，院長和副院長分別由數(shù)學與系統(tǒng)科學研究院的院長和分管教育的副院長擔任。2014年由數(shù)學與系統(tǒng)科學研究院承辦科教融合數(shù)學科學學院，現(xiàn)任院長為席南華院士。數(shù)學科學學院集成了中國科學院大學、數(shù)學與系統(tǒng)科學研究院的綜合優(yōu)勢，本科生和研究生課程體系先進、規(guī)范，科研環(huán)境優(yōu)良，擁有一支科教融合的高水平的師資隊伍，并由國內外知名的專家、學者擔任授課教師。數(shù)學科學學院的師資隊伍包括專任教師、崗位教師，其中專任教師31人，崗位教師130人，包括院士6人，杰青41人，教授（研究員）112人、副教授（副研究員）42人。數(shù)學科學學院下設6個教研室，分別為分析數(shù)學教研室、幾何與拓撲教研室、代數(shù)與數(shù)論教研室、計算數(shù)學與計算機數(shù)學教研室、概率論與數(shù)理統(tǒng)計教研室、運籌學與控制論教研室。

數(shù)學科學學院現(xiàn)有五個一級學科和15個二級學科博士學位授權點，分布在數(shù)學、系統(tǒng)科學、統(tǒng)計學、計算機科學與技術、管理科學與工程五個一級學科。