山西醫(yī)科大學基礎(chǔ)醫(yī)學院辦學歷史可以追溯到1919年“私立山西川至醫(yī)學?？茖W?！苯ㄐ３跗?，當時即開設(shè)有人體解剖學、藥理學、微生物學等多門醫(yī)學基礎(chǔ)課程。1958年初成立基礎(chǔ)醫(yī)學部，1999年更名為基礎(chǔ)醫(yī)學院。

在一代代師生員工的共同努力下，學院得到了長足發(fā)展。尤其近十年來，學院搶抓機遇，注重內(nèi)涵建設(shè)，各項工作均取得了顯著成績。

目前，基礎(chǔ)醫(yī)學院下設(shè)1個學系、12個教研室、7個實驗室、5個研究所、1個國家級實驗教學示范中心（基礎(chǔ)醫(yī)學）、1個省級虛擬仿真實驗教學中心（基礎(chǔ)醫(yī)學）?，F(xiàn)有2個一級學科博士授權(quán)點和2個一級學科碩士授權(quán)點(基礎(chǔ)醫(yī)學、生物學)、1個博士后流動站（生物學）；1個國家重點學科、1個部級重點實驗室，3個省級重點學科，2個創(chuàng)新團隊，擁有一批國內(nèi)先進水平的科研基地和實驗技術(shù)平臺。